MIKRA implementira direktno kreditiranje kroz svoje filijale. Centrala je smještena u Sarajevu, zajedno sa Predstavništvom Sarajevo koja pokriva područje SA, ZE-DO i SB Kantona sa pripadajućim terenskim kancelarijama. Drugo predstavništvo je smješteno u Banja Luci za područje zapadnog dijela RS i Bihaćke regije sa pripadajućim terenskim kancelarijama, dok je treće predstavništvo smješteno u Tuzli sa pripadajućim terenskim kancelarijama. MIKRA praktikuje sklapanje ugovora sa lokalnim NVO-ijama u cilju podrške promotivnim aktivnostima što takođe ojačava MIKRA-ine kontakte u lokalnim zajednicama.